Studi strutturali ed energetici del riconoscimento del DNA e dell’attivazione trascrizionale del fattore di trascrizione 1 della tiroide.

I fattori di trascrizione sono proteine in grado di legarsi al DNA e di interagire con la RNA polimerasi per promuovere il processo di trascrizione. Nella loro sequenza sono inclusi due domini funzionali il “DNA-binding domain” che sceglie il gene da esprimere e il dominio di trans attivazione che ne promuove l’espressione. Attualmente, un numero significativo di strutture di fattori di trascrizione legati al DNA bersaglio e’ stato risolto, ma molti quesiti sono ancora aperti: ad esempio non esiste una semplice correlazione tra gli amminoacidi della proteina e le basi del DNA che interagiscono. Inoltre, nei domini di trans attivazione vi e’ un grado notevole di disordine strutturale. E’ verosimile supporre che le variazioni conformazionali indotte sulla struttura dell’omeodominio, in seguito al legame con il suo DNA specifico, si propaghino alle regioni contigue della proteina. Questo potrebbe essere un meccanismo attraverso il quale veicolare lo scambio di informazioni tra domini distanti della stessa proteina e controllare lo stato funzionale delle regioni regolative. Il presente progetto di ricerca, attraverso la caratterizzazione strutturale ed energetica del riconoscimento del DNA e dell'attività trascrizionale del fattore di trascrizione tiroideo (TTF-1), contribuirà alla comprensione dei requisiti strutturali ed energetici che presiedono all' interazione proteina/DNA e che ne regolano l' attivita’ trascrizionale.