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Esposito, Andrea

Esposito, Andrea  

DIPARTIMENTO DI FISICA "ETTORE PANCINI"  

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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autore(i) File
Predicting chromatin architecture from models of polymer physics 1.1 Articolo in rivista 2017 Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
The scaling features of the 3D organization of chromosomes are highlighted by a transformation a la Kadanoff of Hi-C data 1.1 Articolo in rivista 2017 Chiariello, Andrea M.; Bianco, Simona; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
Structure of the human chromosome interaction network 1.1 Articolo in rivista 2017 Sarnataro, Sergio; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario
A polymer physics investigation of the architecture of the murine orthologue of the 7q11.23 human locus 1.1 Articolo in rivista 2017 Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin 1.1 Articolo in rivista 2018 Annunziatella, Carlo; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Dynamic 3D chromatin architecture contributes to enhancer specificity and limb morphogenesis 1.1 Articolo in rivista 2018 Kragesteen, B. K.; Spielmann, M.; Paliou, C.; Riedel, FRANK HEINRICH; Schoepflin, R.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Jerkovic, I.; Harabula, I.; Guckelberger, P.; Pechstein, M.; Wittler, L.; Chan, W. -L.; Franke, M.; Lupianez, D. G.; Kraft, K.; Timmermann, B.; Vingron, M.; Visel, A.; Nicodemi, Mario; Mundlos, S.; Andrey, G.
Models of polymer physics for the architecture of the cell nucleus 1.1 Articolo in rivista 2019 Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Inference of chromosome 3D structures from GAM data by a physics computational approach 1.1 Articolo in rivista 2020 Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Barbieri, M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M.
Preformed chromatin topology assists transcriptional robustness of Shh during limb development 1.1 Articolo in rivista 2019 Paliou, C.; Guckelberger, P.; Schopflin, R.; Heinrich, V.; Esposito, A.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Annunziatella, C.; Helmuth, J.; Haas, S.; Jerkovic, I.; Brieske, N.; Wittler, L.; Timmermann, B.; Nicodemi, M.; Vingron, M.; Mundlos, S.; Andrey, G.
Modeling Single-Molecule Conformations of the HoxD Region in Mouse Embryonic Stem and Cortical Neuronal Cells 1.1 Articolo in rivista 2019 Bianco, S.; Annunziatella, C.; Andrey, G.; Chiariello, A. M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Prisco, A.; Conte, Mattia; Campanile, Raffaele; Nicodemi, M.
A Dynamic Folded Hairpin Conformation Is Associated with α-Globin Activation in Erythroid Cells 1.1 Articolo in rivista 2020 Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Oudelaar, A. M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Larke, M. S. C.; Telenius, J. M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Buckle, V. J.; Higgs, D. R.; Hughes, J. R.; Nicodemi, M.
Computational approaches from polymer physics to investigate chromatin folding 1.1 Articolo in rivista 2020 Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Conte, M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Musella, F.; Nicodemi, M.
A modern challenge of polymer physics: Novel ways to study, interpret, and reconstruct chromatin structure 1.1 Articolo in rivista 2020 Fiorillo, L.; Bianco, S.; Esposito, A.; Conte, M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Chiariello, A. M.
Physical mechanisms of chromatin spatial organization 1.1 Articolo in rivista 2021 Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Irani, E.; Musella, F.; Abraham, A.; Prisco, A.; Nicodemi, M.
Understanding chromatin structure: Efficient computational implementation of polymer physics models 4.1 Articoli in Atti di convegno 2019 Bianco, S.; Annunziatella, C.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Campanile, R.; Chiariello, A. M.
Hybrid Machine Learning and Polymer Physics Approach to Investigate 3D Chromatin Structure 4.1 Articoli in Atti di convegno 2020 Conte, M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Annunziatella, C.; Corrado, A.; Musella, F.; Sciarretta, R.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.
Higher-order Chromosome Structures Investigated by Polymer Physics in Cellular Morphogenesis and Differentiation 1.1 Articolo in rivista 2020 Esposito, A.; Chiariello, A. M.; Conte, M.; Fiorillo, L.; Musella, F.; Sciarretta, R.; Bianco, S.
Analysis of Genome Architecture Mapping Data with a Machine Learning and Polymer-Physics-Based Tool 4.1 Articoli in Atti di convegno 2021 Fiorillo, L.; Conte, M.; Esposito, A.; Musella, F.; Flora, F.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.
Polymer models are a versatile tool to study chromatin 3d organization 1.1 Articolo in rivista 2021 Esposito, A.; Bianco, S.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Abraham, A.; Musella, F.; Nicodemi, M.; Prisco, A.; Chiariello, A. M.
A Polymer Physics Model to Dissect Genome Organization in Healthy and Pathological Phenotypes 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) 2022 Conte, M.; Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Esposito, A.; Musella, F.; Flora, F.; Abraham, A.; Nicodemi, M.