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Abraham, Alex

Abraham, Alex  

DIPARTIMENTO DI FISICA "ETTORE PANCINI"  

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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autore(i) File
Proceedings - The 4th International Symposium on Information Assurance and Security, IAS 2008: Chiars' welocome massage 7.1 Curatore o Editor di Libri Scientifici 2008 Rak, M.; Abraham, A.; Casola, V.; Zhang, N.
Physical mechanisms of chromatin spatial organization 1.1 Articolo in rivista 2021 Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Irani, E.; Musella, F.; Abraham, A.; Prisco, A.; Nicodemi, M.
Comparison of the Hi-C, GAM and SPRITE methods using polymer models of chromatin 1.1 Articolo in rivista 2021 Fiorillo, L.; Musella, F.; Conte, M.; Kempfer, R.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Kukalev, A.; Irastorza-Azcarate, I.; Esposito, A.; Abraham, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M.
Polymer models are a versatile tool to study chromatin 3d organization 1.1 Articolo in rivista 2021 Esposito, A.; Bianco, S.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Abraham, A.; Musella, F.; Nicodemi, M.; Prisco, A.; Chiariello, A. M.
A Polymer Physics Model to Dissect Genome Organization in Healthy and Pathological Phenotypes 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) 2022 Conte, M.; Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Esposito, A.; Musella, F.; Flora, F.; Abraham, A.; Nicodemi, M.
Loop-extrusion and polymer phase-separation can co-exist at the single-molecule level to shape chromatin folding 1.1 Articolo in rivista 2022 Conte, Mattia; Irani, Ehsan; Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
Unveiling the Machinery behind Chromosome Folding by Polymer Physics Modeling 1.1 Articolo in rivista 2023 Conte, Mattia; Esposito, Andrea; Vercellone, Francesca; Abraham, Alex; Bianco, Simona
The Physics of DNA Folding: Polymer Models and Phase-Separation 1.1 Articolo in rivista 2022 Esposito, Andrea; Abraham, Alex; Conte, Mattia; Vercellone, Francesca; Prisco, Antonella; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.
Polymer Models of Chromatin Imaging Data in Single Cells 1.2 Recensione in rivista 2022 Conte, Mattia; Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario; Matteuzzi, Tommaso; Vercellone, Francesca
Multiscale modelling of chromatin 4D organization in SARS-CoV-2 infected cells 1.1 Articolo in rivista 2024 Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Esposito, Andrea; Fontana, Andrea; Vercellone, Francesca; Conte, Mattia; Nicodemi, Mario
Polymer physics reveals a combinatorial code linking 3D chromatin architecture to 1D chromatin states 1.1 Articolo in rivista 2022 Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Abraham, Alex; Fiorillo, Luca; Conte, Mattia; Campanile, Raffaele; Nicodemi, Mario
Dynamic and equilibrium properties of finite-size polymer models of chromosome folding 1.1 Articolo in rivista 2021 Conte, Mattia; Fiorillo, Luca; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Musella, Francesco; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.
Polymer Physics Models Reveal Structural Folding Features of Single-Molecule Gene Chromatin Conformations 1.1 Articolo in rivista 2024 Conte, Mattia; Abraham, Alex; Esposito, Andrea; Yang, Liyan; Gibcus, Johan H.; Parsi, Krishna M.; Vercellone, Francesca; Fontana, Andrea; Di Pierno, Florinda; Dekker, Job; Nicodemi, Mario
High-performance computing in biological physics 4.1 Articoli in Atti di convegno 2024 Esposito, Andrea; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Conte, Mattia; DI PIERNO, Florinda; Fontana, Andrea; Goha, Sougata; Vercellone, Francesca; Nicodemi, Mario
A Multiscale Perspective on Chromatin Architecture through Polymer Physics 1.1 Articolo in rivista 2024 Vercellone, Francesca; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Conte, Mattia; Abraham, Alex; Fontana, Andrea; Di Pierno, Florinda; Tafuri, Fabrizio; Guha, Sougata; Kundu, Sumanta; Di Carluccio, Ciro; Nicodemi, Mario; Bianco, Simona