ANNUNZIATELLA, CARLO
ANNUNZIATELLA, CARLO
DIPARTIMENTO DI FISICA "ETTORE PANCINI"
Polymer physics of the large-scale structure of chromatin
2016 Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
Predicting chromatin architecture from models of polymer physics
2017 Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
Polymer models of the hierarchical folding of the Hox-B chromosomal locus
2016 Annunziatella, Carlo; Chiariello, ANDREA MARIA; Bianco, Simona; Nicodemi, Mario
The scaling features of the 3D organization of chromosomes are highlighted by a transformation a la Kadanoff of Hi-C data
2017 Chiariello, Andrea M.; Bianco, Simona; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario
A polymer physics investigation of the architecture of the murine orthologue of the 7q11.23 human locus
2017 Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario
Polymer physics predicts the effects of structural variants on chromatin architecture
2018 Bianco, Simona; Lupiáñez, Darío G.; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Kraft, Katerina; Schöpflin, Robert; Wittler, Lars; Andrey, Guillaume; Vingron, Martin; Pombo, Ana; Mundlos, Stefan; Nicodemi, Mario
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin
2018 Annunziatella, Carlo; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Dynamic 3D chromatin architecture contributes to enhancer specificity and limb morphogenesis
2018 Kragesteen, B. K.; Spielmann, M.; Paliou, C.; Riedel, FRANK HEINRICH; Schoepflin, R.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Jerkovic, I.; Harabula, I.; Guckelberger, P.; Pechstein, M.; Wittler, L.; Chan, W. -L.; Franke, M.; Lupianez, D. G.; Kraft, K.; Timmermann, B.; Vingron, M.; Visel, A.; Nicodemi, Mario; Mundlos, S.; Andrey, G.
Models of polymer physics for the architecture of the cell nucleus
2019 Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Inference of chromosome 3D structures from GAM data by a physics computational approach
2020 Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Barbieri, M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M.
A Dynamic Folded Hairpin Conformation Is Associated with α-Globin Activation in Erythroid Cells
2020 Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Oudelaar, A. M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Larke, M. S. C.; Telenius, J. M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Buckle, V. J.; Higgs, D. R.; Hughes, J. R.; Nicodemi, M.
Understanding chromatin structure: Efficient computational implementation of polymer physics models
2019 Bianco, S.; Annunziatella, C.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Campanile, R.; Chiariello, A. M.
Hybrid Machine Learning and Polymer Physics Approach to Investigate 3D Chromatin Structure
2020 Conte, M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Annunziatella, C.; Corrado, A.; Musella, F.; Sciarretta, R.; Chiariello, A. M.; Bianco, S.
The Strings and Binders Switch Model of Chromatin
2019 Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario
Multiplex-GAM: genome-wide identification of chromatin contacts yields insights overlooked by Hi-C
2023 Beagrie, Robert A; Thieme, Christoph J; Annunziatella, Carlo; Baugher, Catherine; Zhang, Yingnan; Schueler, Markus; Kukalev, Alexander; Kempfer, Rieke; Chiariello, Andrea M; Bianco, Simona; Li, Yichao; Davis, Trenton; Scialdone, Antonio; Welch, Lonnie R; Nicodemi, Mario; Pombo, Ana
Dynamic and equilibrium properties of finite-size polymer models of chromosome folding
2021 Conte, Mattia; Fiorillo, Luca; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Musella, Francesco; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.
Efficient computational implementation of polymer physics models to explore chromatin structure
2022 Conte, Mattia; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Campanile, Raffaele; Annunziatella, Carlo; Corrado, Alfonso; Chiariello, Maria Gabriella; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.
Titolo | Tipologia | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
---|---|---|---|---|
Polymer physics of the large-scale structure of chromatin | 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | 2016 | Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario | |
Predicting chromatin architecture from models of polymer physics | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario | |
Polymer models of the hierarchical folding of the Hox-B chromosomal locus | 1.1 Articolo in rivista | 2016 | Annunziatella, Carlo; Chiariello, ANDREA MARIA; Bianco, Simona; Nicodemi, Mario | |
The scaling features of the 3D organization of chromosomes are highlighted by a transformation a la Kadanoff of Hi-C data | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Chiariello, Andrea M.; Bianco, Simona; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Nicodemi, Mario | |
A polymer physics investigation of the architecture of the murine orthologue of the 7q11.23 human locus | 1.1 Articolo in rivista | 2017 | Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Prisco, Antonella; Nicodemi, Mario | |
Polymer physics predicts the effects of structural variants on chromatin architecture | 1.1 Articolo in rivista | 2018 | Bianco, Simona; Lupiáñez, Darío G.; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Kraft, Katerina; Schöpflin, Robert; Wittler, Lars; Andrey, Guillaume; Vingron, Martin; Pombo, Ana; Mundlos, Stefan; Nicodemi, Mario | |
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin | 1.1 Articolo in rivista | 2018 | Annunziatella, Carlo; Chiariello, Andrea M.; Esposito, Andrea; Bianco, Simona; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Dynamic 3D chromatin architecture contributes to enhancer specificity and limb morphogenesis | 1.1 Articolo in rivista | 2018 | Kragesteen, B. K.; Spielmann, M.; Paliou, C.; Riedel, FRANK HEINRICH; Schoepflin, R.; Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, ANDREA MARIA; Jerkovic, I.; Harabula, I.; Guckelberger, P.; Pechstein, M.; Wittler, L.; Chan, W. -L.; Franke, M.; Lupianez, D. G.; Kraft, K.; Timmermann, B.; Vingron, M.; Visel, A.; Nicodemi, Mario; Mundlos, S.; Andrey, G. | |
Models of polymer physics for the architecture of the cell nucleus | 1.1 Articolo in rivista | 2019 | Esposito, Andrea; Annunziatella, Carlo; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Inference of chromosome 3D structures from GAM data by a physics computational approach | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Fiorillo, L.; Bianco, S.; Chiariello, A. M.; Barbieri, M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Pombo, A.; Nicodemi, M. | |
A Dynamic Folded Hairpin Conformation Is Associated with α-Globin Activation in Erythroid Cells | 1.1 Articolo in rivista | 2020 | Chiariello, A. M.; Bianco, S.; Oudelaar, A. M.; Esposito, A.; Annunziatella, C.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Corrado, A.; Prisco, A.; Larke, M. S. C.; Telenius, J. M.; Sciarretta, R.; Musella, F.; Buckle, V. J.; Higgs, D. R.; Hughes, J. R.; Nicodemi, M. | |
Understanding chromatin structure: Efficient computational implementation of polymer physics models | 4.1 Articoli in Atti di convegno | 2019 | Bianco, S.; Annunziatella, C.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Conte, M.; Campanile, R.; Chiariello, A. M. | |
Hybrid Machine Learning and Polymer Physics Approach to Investigate 3D Chromatin Structure | 4.1 Articoli in Atti di convegno | 2020 | Conte, M.; Esposito, A.; Fiorillo, L.; Annunziatella, C.; Corrado, A.; Musella, F.; Sciarretta, R.; Chiariello, A. M.; Bianco, S. | |
The Strings and Binders Switch Model of Chromatin | 2.1 Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | 2019 | Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M.; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Nicodemi, Mario | |
Multiplex-GAM: genome-wide identification of chromatin contacts yields insights overlooked by Hi-C | 1.1 Articolo in rivista | 2023 | Beagrie, Robert A; Thieme, Christoph J; Annunziatella, Carlo; Baugher, Catherine; Zhang, Yingnan; Schueler, Markus; Kukalev, Alexander; Kempfer, Rieke; Chiariello, Andrea M; Bianco, Simona; Li, Yichao; Davis, Trenton; Scialdone, Antonio; Welch, Lonnie R; Nicodemi, Mario; Pombo, Ana | |
Dynamic and equilibrium properties of finite-size polymer models of chromosome folding | 1.1 Articolo in rivista | 2021 | Conte, Mattia; Fiorillo, Luca; Annunziatella, Carlo; Esposito, Andrea; Musella, Francesco; Abraham, Alex; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M. | |
Efficient computational implementation of polymer physics models to explore chromatin structure | 1.1 Articolo in rivista | 2022 | Conte, Mattia; Esposito, Andrea; Fiorillo, Luca; Campanile, Raffaele; Annunziatella, Carlo; Corrado, Alfonso; Chiariello, Maria Gabriella; Bianco, Simona; Chiariello, Andrea M. |