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Autoimmune diseases (AIDs) are polygenic diseases affecting 7-10% of the population in the Western Hemisphere with few effective therapies. Here, we quantify the heritability of paediatric AIDs (pAIDs), including JIA, SLE, CEL, T1D, UC, CD, PS, SPA and CVID, attributable to common genomic variations (SNP-h(2)). SNP-h(2) estimates are most significant for T1D (0.863±s.e. 0.07) and JIA (0.727±s.e. 0.037), more modest for UC (0.386±s.e. 0.04) and CD (0.454±0.025), largely consistent with population estimates and are generally greater than that previously reported by adult GWAS. On pairwise analysis, we observed that the diseases UC-CD (0.69±s.e. 0.07) and JIA-CVID (0.343±s.e. 0.13) are the most strongly correlated. Variations across the MHC strongly contribute to SNP-h(2) in T1D and JIA, but does not significantly contribute to the pairwise rG. Together, our results partition contributions of shared versus disease-specific genomic variations to pAID heritability, identifying pAIDs with unexpected risk sharing, while recapitulating known associations between autoimmune diseases previously reported in adult cohorts.
Genetic sharing and heritability of paediatric age of onset autoimmune diseases / Li, Yun R.; Zhao, Sihai D.; Li, Jin; Bradfield, Jonathan P.; Mohebnasab, Maede; Steel, Laura; Kobie, Julie; Abrams, Debra J.; Mentch, Frank D.; Glessner, Joseph T.; Guo, Yiran; Wei, Zhi; Connolly, John J.; Cardinale, Christopher J.; Bakay, Marina; Li, Dong; Maggadottir, S. Melkorka; Thomas, Kelly A.; Qui, Haijun; Chiavacci, Rosetta M.; Kim, Cecilia E.; Wang, Fengxiang; Snyder, James; Flatø, Berit; Førre, Oystein; Denson, Lee A.; Thompson, Susan D.; Becker, Mara L.; Guthery, Stephen L.; Latiano, Anna; Perez, Elena; Resnick, Elena; Strisciuglio, Caterina; Staiano, Annamaria; Miele, Erasmo; Silverberg, Mark S.; Lie, Benedicte A.; Punaro, Marilynn; Russell, Richard K.; Wilson, David C.; Dubinsky, Marla C.; Monos, Dimitri S.; Annese, Vito; Munro, Jane E.; Wise, Carol; Chapel, Helen; Cunningham Rundles, Charlotte; Orange, Jordan S.; Behrens, Edward M.; Sullivan, Kathleen E.; Kugathasan, Subra; Griffiths, Anne M.; Satsangi, Jack; Grant, Struan F. A.; Sleiman, Patrick M. A.; Finkel, Terri H.; Polychronakos, Constantin; Baldassano, Robert N.; Luning Prak, Eline T.; Ellis, Justine A.; Li, Hongzhe; Keating, Brendan J.; Hakonarson, Hakon. - In: NATURE COMMUNICATIONS. - ISSN 2041-1723. - 6:(2015), p. 8442. [10.1038/ncomms9442]
Genetic sharing and heritability of paediatric age of onset autoimmune diseases
Li, Yun R.;Zhao, Sihai D.;Li, Jin;Bradfield, Jonathan P.;Mohebnasab, Maede;Steel, Laura;Kobie, Julie;Abrams, Debra J.;Mentch, Frank D.;Glessner, Joseph T.;Guo, Yiran;Wei, Zhi;Connolly, John J.;Cardinale, Christopher J.;Bakay, Marina;Li, Dong;Maggadottir, S. Melkorka;Thomas, Kelly A.;Qui, Haijun;Chiavacci, Rosetta M.;Kim, Cecilia E.;Wang, Fengxiang;Snyder, James;Flatø, Berit;Førre, Oystein;Denson, Lee A.;Thompson, Susan D.;Becker, Mara L.;Guthery, Stephen L.;Latiano, Anna;Perez, Elena;Resnick, Elena;STRISCIUGLIO, CATERINA;STAIANO, ANNAMARIA;MIELE, ERASMO;Silverberg, Mark S.;Lie, Benedicte A.;Punaro, Marilynn;Russell, Richard K.;Wilson, David C.;Dubinsky, Marla C.;Monos, Dimitri S.;Annese, Vito;Munro, Jane E.;Wise, Carol;Chapel, Helen;Cunningham Rundles, Charlotte;Orange, Jordan S.;Behrens, Edward M.;Sullivan, Kathleen E.;Kugathasan, Subra;Griffiths, Anne M.;Satsangi, Jack;Grant, Struan F. A.;Sleiman, Patrick M. A.;Finkel, Terri H.;Polychronakos, Constantin;Baldassano, Robert N.;Luning Prak, Eline T.;Ellis, Justine A.;Li, Hongzhe;Keating, Brendan J.;Hakonarson, Hakon
2015
Abstract
Autoimmune diseases (AIDs) are polygenic diseases affecting 7-10% of the population in the Western Hemisphere with few effective therapies. Here, we quantify the heritability of paediatric AIDs (pAIDs), including JIA, SLE, CEL, T1D, UC, CD, PS, SPA and CVID, attributable to common genomic variations (SNP-h(2)). SNP-h(2) estimates are most significant for T1D (0.863±s.e. 0.07) and JIA (0.727±s.e. 0.037), more modest for UC (0.386±s.e. 0.04) and CD (0.454±0.025), largely consistent with population estimates and are generally greater than that previously reported by adult GWAS. On pairwise analysis, we observed that the diseases UC-CD (0.69±s.e. 0.07) and JIA-CVID (0.343±s.e. 0.13) are the most strongly correlated. Variations across the MHC strongly contribute to SNP-h(2) in T1D and JIA, but does not significantly contribute to the pairwise rG. Together, our results partition contributions of shared versus disease-specific genomic variations to pAID heritability, identifying pAIDs with unexpected risk sharing, while recapitulating known associations between autoimmune diseases previously reported in adult cohorts.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.