Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (second edition)

Cossarizza, A.; Chang, H. -D.; Radbruch, A.; Acs, A.; Adam, D.; Adam-Klages, S.; Agace, W. W.; Aghaeepour, N.; Akdis, M.; Allez, M.; Almeida, L. N.; Alvisi, G.; Anderson, G.; Andra, I.; Annunziato, F.; Anselmo, A.; Bacher, P.; Baldari, C. T.; Bari, S.; Barnaba, V.; Barros-Martins, J.; Battistini, L.; Bauer, W.; Baumgart, S.; Baumgarth, N.; Baumjohann, D.; Baying, B.; Bebawy, M.; Becher, B.; Beisker, W.; Benes, V.; Beyaert, R.; Blanco, A.; Boardman, D. A.; Bogdan, C.; Borger, J. G.; Borsellino, G.; Boulais, P. E.; Bradford, J. A.; Brenner, D.; Brinkman, R. R.; Brooks, A. E. S.; Busch, D. H.; Buscher, M.; Bushnell, T. P.; Calzetti, F.; Cameron, G.; Cammarata, I.; Cao, X.; Cardell, S. L.; Casola, S.; Cassatella, M. A.; Cavani, A.; Celada, A.; Chatenoud, L.; Chattopadhyay, P. K.; Chow, S.; Christakou, E.; Cicin-Sain, L.; Clerici, M.; Colombo, F. S.; Cook, L.; Cooke, A.; Cooper, A. M.; Corbett, A. J.; Cosma, A.; Cosmi, L.; Coulie, P. G.; Cumano, A.; Cvetkovic, L.; Dang, V. D.; Dang-Heine, C.; Davey, M. S.; Davies, D.; De Biasi, S.; Del Zotto, G.; Dela Cruz, G. V.; Delacher, M.; Della Bella, S.; Dellabona, P.; Deniz, G.; Dessing, M.; Di Santo, J. P.; Diefenbach, A.; Dieli, F.; Dolf, A.; Dorner, T.; Dress, R. J.; Dudziak, D.; Dustin, M.; Dutertre, C. -A.; Ebner, F.; Eckle, S. B. G.; Edinger, M.; Eede, P.; Ehrhardt, G. R. A.; Eich, M.; Engel, P.; Engelhardt, B.; Erdei, A.; Esser, C.; Everts, B.; Evrard, M.; Falk, C. S.; Fehniger, T. A.; Felipo-Benavent, M.; Ferry, H.; Feuerer, M.; Filby, A.; Filkor, K.; Fillatreau, S.; Follo, M.; Forster, I.; Foster, J.; Foulds, G. A.; Frehse, B.; Frenette, P. S.; Frischbutter, S.; Fritzsche, W.; Galbraith, D. W.; Gangaev, A.; Garbi, N.; Gaudilliere, B.; Gazzinelli, R. T.; Geginat, J.; Gerner, W.; Gherardin, N. A.; Ghoreschi, K.; Gibellini, L.; Ginhoux, F.; Goda, K.; Godfrey, D. I.; Goettlinger, C.; Gonzalez-Navajas, J. M.; Goodyear, C. S.; Gori, A.; Grogan, J. L.; Grummitt, D.; Grutzkau, A.; Haftmann, C.; Hahn, J.; Hammad, H.; Hammerling, G.; Hansmann, L.; Hansson, G.; Harpur, C. M.; Hartmann, S.; Hauser, A.; Hauser, A. E.; Haviland, D. L.; Hedley, D.; Hernandez, D. C.; Herrera, G.; Herrmann, M.; Hess, C.; Hofer, T.; Hoffmann, P.; Hogquist, K.; Holland, T.; Hollt, T.; Holmdahl, R.; Hombrink, P.; Houston, J. P.; Hoyer, B. F.; Huang, B.; Huang, F. -P.; Huber, J. E.; Huehn, J.; Hundemer, M.; Hunter, C. A.; Hwang, W. Y. K.; Iannone, A.; Ingelfinger, F.; Ivison, S. M.; Jack, H. -M.; Jani, P. K.; Javega, B.; Jonjic, S.; Kaiser, T.; Kalina, T.; Kamradt, T.; Kaufmann, S. H. E.; Keller, B.; Ketelaars, S. L. C.; Khalilnezhad, A.; Khan, S.; Kisielow, J.; Klenerman, P.; Knopf, J.; Koay, H. -F.; Kobow, K.; Kolls, J. K.; Kong, W. T.; Kopf, M.; Korn, T.; Kriegsmann, K.; Kristyanto, H.; Kroneis, T.; Krueger, A.; Kuhne, J.; Kukat, C.; Kunkel, D.; Kunze-Schumacher, H.; Kurosaki, T.; Kurts, C.; Kvistborg, P.; Kwok, I.; Landry, J.; Lantz, O.; Lanuti, P.; Larosa, F.; Lehuen, A.; LeibundGut-Landmann, S.; Leipold, M. D.; Leung, L. Y. T.; Levings, M. K.; Lino, A. C.; Liotta, F.; Litwin, V.; Liu, Y.; Ljunggren, H. -G.; Lohoff, M.; Lombardi, G.; Lopez, L.; Lopez-Botet, M.; Lovett-Racke, A. E.; Lubberts, E.; Luche, H.; Ludewig, B.; Lugli, E.; Lunemann, S.; Maecker, H. T.; Maggi, L.; Maguire, O.; Mair, F.; Mair, K. H.; Mantovani, A.; Manz, R. A.; Marshall, A. J.; Martinez-Romero, A.; Martrus, G.; Marventano, I.; Maslinski, W.; Matarese, G.; Mattioli, A. V.; Maueroder, C.; Mazzoni, A.; Mccluskey, J.; Mcgrath, M.; Mcguire, H. M.; Mcinnes, I. B.; Mei, H. E.; Melchers, F.; Melzer, S.; Mielenz, D.; Miller, S. D.; Mills, K. H. G.; Minderman, H.; Mjosberg, J.; Moore, J.; Moran, B.; Moretta, L.; Mosmann, T. R.; Muller, S.; Multhoff, G.; Munoz, L. E.; Munz, C.; Nakayama, T.; Nasi, M.; Neumann, K.; L. G., Ng; Niedobitek, A.; Nourshargh, S.; Nunez, G.; O'Connor, J. -E.; Ochel, A.; Oja, A.; Ordonez, D.; Orfao, A.; Orlowski-Oliver, E.; Ouyang, W.; Oxenius, A.; Palankar, R.; Panse, I.; Pattanapanyasat, K.; Paulsen, M.; Pavlinic, D.; Penter, L.; Peterson, P.; Peth, C.; Petriz, J.; Piancone, F.; Pickl, W. F.; Piconese, S.; Pinti, M.; Pockley, A. G.; Podolska, M. J.; Poon, Z.; Pracht, K.; Prinz, I.; Pucillo, C. E. M.; Quataert, S. A.; Quatrini, L.; Quinn, K. M.; Radbruch, H.; Radstake, T. R. D. J.; Rahmig, S.; Rahn, H. -P.; Rajwa, B.; Ravichandran, G.; Raz, Y.; Rebhahn, J. A.; Recktenwald, D.; Reimer, D.; Reis e Sousa, C.; Remmerswaal, E. B. M.; Richter, L.; Rico, L. G.; Riddell, A.; Rieger, A. M.; Robinson, J. P.; Romagnani, C.; Rubartelli, A.; Ruland, J.; Saalmuller, A.; Saeys, Y.; Saito, T.; Sakaguchi, S.; Sala-de-Oyanguren, F.; Samstag, Y.; Sanderson, S.; Sandrock, I.; Santoni, A.; Sanz, R. B.; Saresella, M.; Sautes-Fridman, C.; Sawitzki, B.; Schadt, L.; Scheffold, A.; Scherer, H. U.; Schiemann, M.; Schildberg, F. A.; Schimisky, E.; Schlitzer, A.; Schlosser, J.; Schmid, S.; Schmitt, S.; Schober, K.; Schraivogel, D.; Schuh, W.; Schuler, T.; Schulte, R.; Schulz, A. R.; Schulz, S. R.; Scotta, C.; Scott-Algara, D.; Sester, D. P.; Shankey, T. V.; Silva-Santos, B.; Simon, A. K.; Sitnik, K. M.; Sozzani, S.; Speiser, D. E.; Spidlen, J.; Stahlberg, A.; Stall, A. M.; Stanley, N.; Stark, R.; Stehle, C.; Steinmetz, T.; Stockinger, H.; Takahama, Y.; Takeda, K.; Tan, L.; Tarnok, A.; Tiegs, G.; Toldi, G.; Tornack, J.; Traggiai, E.; Trebak, M.; Tree, T. I. M.; Trotter, J.; Trowsdale, J.; Tsoumakidou, M.; Ulrich, H.; Urbanczyk, S.; van de Veen, W.; van den Broek, M.; van der Pol, E.; Van Gassen, S.; Van Isterdael, G.; van Lier, R. A. W.; Veldhoen, M.; Vento-Asturias, S.; Vieira, P.; Voehringer, D.; Volk, H. -D.; von Borstel, A.; von Volkmann, K.; Waisman, A.; Walker, R. V.; Wallace, P. K.; Wang, S. A.; Wang, X. M.; Ward, M. D.; Ward-Hartstonge, K. A.; Warnatz, K.; Warnes, G.; Warth, S.; Waskow, C.; Watson, J. V.; Watzl, C.; Wegener, L.; Weisenburger, T.; Wiedemann, A.; Wienands, J.; Wilharm, A.; Wilkinson, R. J.; Willimsky, G.; Wing, J. B.; Winkelmann, R.; Winkler, T. H.; Wirz, O. F.; Wong, A.; Wurst, P.; Yang, J. H. M.; Yang, J.; Yazdanbakhsh, M.; Yu, L.; Yue, A.; Zhang, H.; Zhao, Y.; Ziegler, S. M.; Zielinski, C.; Zimmermann, J.; Zychlinsky, A.

doi:10.1002/eji.201970107

These guidelines are a consensus work of a considerable number of members of the immunology and flow cytometry community. They provide the theory and key practical aspects of flow cytometry enabling immunologists to avoid the common errors that often undermine immunological data. Notably, there are comprehensive sections of all major immune cell types with helpful Tables detailing phenotypes in murine and human cells. The latest flow cytometry techniques and applications are also described, featuring examples of the data that can be generated and, importantly, how the data can be analysed. Furthermore, there are sections detailing tips, tricks and pitfalls to avoid, all written and peer-reviewed by leading experts in the field, making this an essential research companion.

Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (second edition) / Cossarizza, A.; Chang, H. -D.; Radbruch, A.; Acs, A.; Adam, D.; Adam-Klages, S.; Agace, W. W.; Aghaeepour, N.; Akdis, M.; Allez, M.; Almeida, L. N.; Alvisi, G.; Anderson, G.; Andra, I.; Annunziato, F.; Anselmo, A.; Bacher, P.; Baldari, C. T.; Bari, S.; Barnaba, V.; Barros-Martins, J.; Battistini, L.; Bauer, W.; Baumgart, S.; Baumgarth, N.; Baumjohann, D.; Baying, B.; Bebawy, M.; Becher, B.; Beisker, W.; Benes, V.; Beyaert, R.; Blanco, A.; Boardman, D. A.; Bogdan, C.; Borger, J. G.; Borsellino, G.; Boulais, P. E.; Bradford, J. A.; Brenner, D.; Brinkman, R. R.; Brooks, A. E. S.; Busch, D. H.; Buscher, M.; Bushnell, T. P.; Calzetti, F.; Cameron, G.; Cammarata, I.; Cao, X.; Cardell, S. L.; Casola, S.; Cassatella, M. A.; Cavani, A.; Celada, A.; Chatenoud, L.; Chattopadhyay, P. K.; Chow, S.; Christakou, E.; Cicin-Sain, L.; Clerici, M.; Colombo, F. S.; Cook, L.; Cooke, A.; Cooper, A. M.; Corbett, A. J.; Cosma, A.; Cosmi, L.; Coulie, P. G.; Cumano, A.; Cvetkovic, L.; Dang, V. D.; Dang-Heine, C.; Davey, M. S.; Davies, D.; De Biasi, S.; Del Zotto, G.; Dela Cruz, G. V.; Delacher, M.; Della Bella, S.; Dellabona, P.; Deniz, G.; Dessing, M.; Di Santo, J. P.; Diefenbach, A.; Dieli, F.; Dolf, A.; Dorner, T.; Dress, R. J.; Dudziak, D.; Dustin, M.; Dutertre, C. -A.; Ebner, F.; Eckle, S. B. G.; Edinger, M.; Eede, P.; Ehrhardt, G. R. A.; Eich, M.; Engel, P.; Engelhardt, B.; Erdei, A.; Esser, C.; Everts, B.; Evrard, M.; Falk, C. S.; Fehniger, T. A.; Felipo-Benavent, M.; Ferry, H.; Feuerer, M.; Filby, A.; Filkor, K.; Fillatreau, S.; Follo, M.; Forster, I.; Foster, J.; Foulds, G. A.; Frehse, B.; Frenette, P. S.; Frischbutter, S.; Fritzsche, W.; Galbraith, D. W.; Gangaev, A.; Garbi, N.; Gaudilliere, B.; Gazzinelli, R. T.; Geginat, J.; Gerner, W.; Gherardin, N. A.; Ghoreschi, K.; Gibellini, L.; Ginhoux, F.; Goda, K.; Godfrey, D. I.; Goettlinger, C.; Gonzalez-Navajas, J. M.; Goodyear, C. S.; Gori, A.; Grogan, J. L.; Grummitt, D.; Grutzkau, A.; Haftmann, C.; Hahn, J.; Hammad, H.; Hammerling, G.; Hansmann, L.; Hansson, G.; Harpur, C. M.; Hartmann, S.; Hauser, A.; Hauser, A. E.; Haviland, D. L.; Hedley, D.; Hernandez, D. C.; Herrera, G.; Herrmann, M.; Hess, C.; Hofer, T.; Hoffmann, P.; Hogquist, K.; Holland, T.; Hollt, T.; Holmdahl, R.; Hombrink, P.; Houston, J. P.; Hoyer, B. F.; Huang, B.; Huang, F. -P.; Huber, J. E.; Huehn, J.; Hundemer, M.; Hunter, C. A.; Hwang, W. Y. K.; Iannone, A.; Ingelfinger, F.; Ivison, S. M.; Jack, H. -M.; Jani, P. K.; Javega, B.; Jonjic, S.; Kaiser, T.; Kalina, T.; Kamradt, T.; Kaufmann, S. H. E.; Keller, B.; Ketelaars, S. L. C.; Khalilnezhad, A.; Khan, S.; Kisielow, J.; Klenerman, P.; Knopf, J.; Koay, H. -F.; Kobow, K.; Kolls, J. K.; Kong, W. T.; Kopf, M.; Korn, T.; Kriegsmann, K.; Kristyanto, H.; Kroneis, T.; Krueger, A.; Kuhne, J.; Kukat, C.; Kunkel, D.; Kunze-Schumacher, H.; Kurosaki, T.; Kurts, C.; Kvistborg, P.; Kwok, I.; Landry, J.; Lantz, O.; Lanuti, P.; Larosa, F.; Lehuen, A.; LeibundGut-Landmann, S.; Leipold, M. D.; Leung, L. Y. T.; Levings, M. K.; Lino, A. C.; Liotta, F.; Litwin, V.; Liu, Y.; Ljunggren, H. -G.; Lohoff, M.; Lombardi, G.; Lopez, L.; Lopez-Botet, M.; Lovett-Racke, A. E.; Lubberts, E.; Luche, H.; Ludewig, B.; Lugli, E.; Lunemann, S.; Maecker, H. T.; Maggi, L.; Maguire, O.; Mair, F.; Mair, K. H.; Mantovani, A.; Manz, R. A.; Marshall, A. J.; Martinez-Romero, A.; Martrus, G.; Marventano, I.; Maslinski, W.; Matarese, G.; Mattioli, A. V.; Maueroder, C.; Mazzoni, A.; Mccluskey, J.; Mcgrath, M.; Mcguire, H. M.; Mcinnes, I. B.; Mei, H. E.; Melchers, F.; Melzer, S.; Mielenz, D.; Miller, S. D.; Mills, K. H. G.; Minderman, H.; Mjosberg, J.; Moore, J.; Moran, B.; Moretta, L.; Mosmann, T. R.; Muller, S.; Multhoff, G.; Munoz, L. E.; Munz, C.; Nakayama, T.; Nasi, M.; Neumann, K.; Ng, L. G.; Niedobitek, A.; Nourshargh, S.; Nunez, G.; O'Connor, J. -E.; Ochel, A.; Oja, A.; Ordonez, D.; Orfao, A.; Orlowski-Oliver, E.; Ouyang, W.; Oxenius, A.; Palankar, R.; Panse, I.; Pattanapanyasat, K.; Paulsen, M.; Pavlinic, D.; Penter, L.; Peterson, P.; Peth, C.; Petriz, J.; Piancone, F.; Pickl, W. F.; Piconese, S.; Pinti, M.; Pockley, A. G.; Podolska, M. J.; Poon, Z.; Pracht, K.; Prinz, I.; Pucillo, C. E. M.; Quataert, S. A.; Quatrini, L.; Quinn, K. M.; Radbruch, H.; Radstake, T. R. D. J.; Rahmig, S.; Rahn, H. -P.; Rajwa, B.; Ravichandran, G.; Raz, Y.; Rebhahn, J. A.; Recktenwald, D.; Reimer, D.; Reis e Sousa, C.; Remmerswaal, E. B. M.; Richter, L.; Rico, L. G.; Riddell, A.; Rieger, A. M.; Robinson, J. P.; Romagnani, C.; Rubartelli, A.; Ruland, J.; Saalmuller, A.; Saeys, Y.; Saito, T.; Sakaguchi, S.; Sala-de-Oyanguren, F.; Samstag, Y.; Sanderson, S.; Sandrock, I.; Santoni, A.; Sanz, R. B.; Saresella, M.; Sautes-Fridman, C.; Sawitzki, B.; Schadt, L.; Scheffold, A.; Scherer, H. U.; Schiemann, M.; Schildberg, F. A.; Schimisky, E.; Schlitzer, A.; Schlosser, J.; Schmid, S.; Schmitt, S.; Schober, K.; Schraivogel, D.; Schuh, W.; Schuler, T.; Schulte, R.; Schulz, A. R.; Schulz, S. R.; Scotta, C.; Scott-Algara, D.; Sester, D. P.; Shankey, T. V.; Silva-Santos, B.; Simon, A. K.; Sitnik, K. M.; Sozzani, S.; Speiser, D. E.; Spidlen, J.; Stahlberg, A.; Stall, A. M.; Stanley, N.; Stark, R.; Stehle, C.; Steinmetz, T.; Stockinger, H.; Takahama, Y.; Takeda, K.; Tan, L.; Tarnok, A.; Tiegs, G.; Toldi, G.; Tornack, J.; Traggiai, E.; Trebak, M.; Tree, T. I. M.; Trotter, J.; Trowsdale, J.; Tsoumakidou, M.; Ulrich, H.; Urbanczyk, S.; van de Veen, W.; van den Broek, M.; van der Pol, E.; Van Gassen, S.; Van Isterdael, G.; van Lier, R. A. W.; Veldhoen, M.; Vento-Asturias, S.; Vieira, P.; Voehringer, D.; Volk, H. -D.; von Borstel, A.; von Volkmann, K.; Waisman, A.; Walker, R. V.; Wallace, P. K.; Wang, S. A.; Wang, X. M.; Ward, M. D.; Ward-Hartstonge, K. A.; Warnatz, K.; Warnes, G.; Warth, S.; Waskow, C.; Watson, J. V.; Watzl, C.; Wegener, L.; Weisenburger, T.; Wiedemann, A.; Wienands, J.; Wilharm, A.; Wilkinson, R. J.; Willimsky, G.; Wing, J. B.; Winkelmann, R.; Winkler, T. H.; Wirz, O. F.; Wong, A.; Wurst, P.; Yang, J. H. M.; Yang, J.; Yazdanbakhsh, M.; Yu, L.; Yue, A.; Zhang, H.; Zhao, Y.; Ziegler, S. M.; Zielinski, C.; Zimmermann, J.; Zychlinsky, A.. - In: EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. - ISSN 0014-2980. - 49:10(2019), pp. 1457-1973. [10.1002/eji.201970107]