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Gene fusions assays are key for personalised treatments of advanced human cancers. Their implementation on cytological material requires a preliminary validation that may make use of cell line slides mimicking cytological samples. In this international multi-institutional study, gene fusion reference standards were developed and validated.
Reference standards for gene fusion molecular assays on cytological samples: an international validation study / Malapelle, U., Pepe, F., Pisapia, P., Altimari, A., Bellevicine, C., Brunnström, H., Bruno, R., Büttner, R., Cirnes, L., De Andrea, C.E., de Biase, D., Dumur, C.I., Ericson Lindquist, K., Fontanini, G., Gautiero, E., Gentien, D., Hofman, P., Hofman, V., Iaccarino, A., Lozano, M.D., et al.. - In: JOURNAL OF CLINICAL PATHOLOGY. - ISSN 0021-9746. - 76:(2023), pp. 47-52. [10.1136/jclinpath-2021-207825]
Reference standards for gene fusion molecular assays on cytological samples: an international validation study
Malapelle, Umberto;Pepe, Francesco;Pisapia, Pasquale;Altimari, Annalisa;Bellevicine, Claudio;Brunnström, Hans;Bruno, Rossella;Büttner, Reinhard;Cirnes, Luis;De Andrea, Carlos E;de Biase, Dario;Dumur, Catherine I;Ericson Lindquist, Kajsa;Fontanini, Gabriella;Gautiero, Eugenio;Gentien, David;Hofman, Paul;Hofman, Veronique;Iaccarino, Antonino;Lozano, Maria Dolores;Mayo-de-Las-Casas, Clara;Merkelbach-Bruse, Sabine;Pagni, Fabio;Roman, Ruth;Schmitt, Fernando C;Siemanowski, Janna;Roy-Chowdhuri, Sinchita;Tallini, Giovanni;Tresserra, Francesc;Vander Borght, Sara;Vielh, Philippe;Vigliar, Elena;Vita, Giulia Anna Carmen;Weynand, Birgit;Rosell, Rafael;Molina Vila, Miguel Angel;Troncone, Giancarlo
2023
Abstract
Gene fusions assays are key for personalised treatments of advanced human cancers. Their implementation on cytological material requires a preliminary validation that may make use of cell line slides mimicking cytological samples. In this international multi-institutional study, gene fusion reference standards were developed and validated.
Reference standards for gene fusion molecular assays on cytological samples: an international validation study / Malapelle, U., Pepe, F., Pisapia, P., Altimari, A., Bellevicine, C., Brunnström, H., Bruno, R., Büttner, R., Cirnes, L., De Andrea, C.E., de Biase, D., Dumur, C.I., Ericson Lindquist, K., Fontanini, G., Gautiero, E., Gentien, D., Hofman, P., Hofman, V., Iaccarino, A., Lozano, M.D., et al.. - In: JOURNAL OF CLINICAL PATHOLOGY. - ISSN 0021-9746. - 76:(2023), pp. 47-52. [10.1136/jclinpath-2021-207825]
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
