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Biological systems are fundamentally multi-scale, with mostly uncharacterized molecular pathways, cellular actions, and cellular communities that collectively give rise to their function. While one high-throughput measurement technology can resolve specific biological molecules, comprehensive characterization of biological systems can only be achieved by integration of multi-modal data types across molecular, cellular, spatial, and population scales. The integration of heterogeneous and complementary assays from multi-omics can reveal interactions between modalities that drive biological systems and processes. Recent advances in single-cell multi-omics technologies provide unprecedented opportunities for such multi-scale characterization but interpreting biological processes from these data requires parallel advances in novel computational techniques.
Community-wide hackathons to identify central themes in single-cell multi-omics / Kim-Anh Lê, C., Al J., A., Emily F., D., Lauren, H., Arshi, A., Alexis, C., Atul, D., Yuzhou, F., Pratheepa, J., Melanie, L., Chen, M., Wancen, M.u., Vera, P., Kris, S., Righelli, D., Amrit, S., Joshua S., S., Genevieve L., S., Ayshwarya, S., Joshua D., W., et al.. - In: GENOME BIOLOGY. - ISSN 1474-760X. - 22:1(2021), pp. 1-21. [10.1186/s13059-021-02433-9]
Community-wide hackathons to identify central themes in single-cell multi-omics
Kim-Anh Lê Cao;Al J. Abadi;Emily F. Davis-Marcisak;Lauren Hsu;Arshi Arora;Alexis Coullomb;Atul Deshpande;Yuzhou Feng;Pratheepa Jeganathan;Melanie Loth;Chen Meng;Wancen Mu;Vera Pancaldi;Kris Sankaran;Righelli D;Amrit Singh;Joshua S. Sodicoff;Genevieve L. Stein-O’Brien;Ayshwarya Subramanian;Joshua D. Welch;Yue You;Ricard Argelaguet;Vincent J. Carey;Ruben Dries;Casey S. Greene;Susan Holmes;Michael I. Love;Matthew E. Ritchie;Guo-Cheng Yuan;Aedin C. Culhane;Elana Fertig
2021
Abstract
Biological systems are fundamentally multi-scale, with mostly uncharacterized molecular pathways, cellular actions, and cellular communities that collectively give rise to their function. While one high-throughput measurement technology can resolve specific biological molecules, comprehensive characterization of biological systems can only be achieved by integration of multi-modal data types across molecular, cellular, spatial, and population scales. The integration of heterogeneous and complementary assays from multi-omics can reveal interactions between modalities that drive biological systems and processes. Recent advances in single-cell multi-omics technologies provide unprecedented opportunities for such multi-scale characterization but interpreting biological processes from these data requires parallel advances in novel computational techniques.
Community-wide hackathons to identify central themes in single-cell multi-omics / Kim-Anh Lê, C., Al J., A., Emily F., D., Lauren, H., Arshi, A., Alexis, C., Atul, D., Yuzhou, F., Pratheepa, J., Melanie, L., Chen, M., Wancen, M.u., Vera, P., Kris, S., Righelli, D., Amrit, S., Joshua S., S., Genevieve L., S., Ayshwarya, S., Joshua D., W., et al.. - In: GENOME BIOLOGY. - ISSN 1474-760X. - 22:1(2021), pp. 1-21. [10.1186/s13059-021-02433-9]
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.