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For the first time in Europe hundreds of rare disease (RD) experts team up to actively share and jointly analyse existing patient’s data. Solve-RD is a Horizon 2020-supported EU flagship project bringing together >300 clinicians, scientists, and patient representatives of 51 sites from 15 countries. Solve-RD is built upon a core group of four European Reference Networks (ERNs; ERN-ITHACA, ERN-RND, ERN-Euro NMD, ERN-GENTURIS) which annually see more than 270,000 RD patients with respective pathologies. The main ambition is to solve unsolved rare diseases for which a molecular cause is not yet known. This is achieved through an innovative clinical research environment that introduces novel ways to organise expertise and data. Two major approaches are being pursued (i) massive data re-analysis of >19,000 unsolved rare disease patients and (ii) novel combined -omics approaches. The minimum requirement to be eligible for the analysis activities is an inconclusive exome that can be shared with controlled access. The first preliminary data re-analysis has already diagnosed 255 cases form 8393 exomes/genome datasets. This unprecedented degree of collaboration focused on sharing of data and expertise shall identify many new disease genes and enable diagnosis of many so far undiagnosed patients from all over Europe.
Solve-RD: systematic pan-European data sharing and collaborative analysis to solve rare diseases / Zurek, B.; Ellwanger, K.; Vissers, L. E. L. M.; Schule, R.; Synofzik, M.; Topf, A.; de Voer, R. M.; Laurie, S.; Matalonga, L.; Gilissen, C.; Ossowski, S.; 't Hoen, P. A. C.; Vitobello, A.; Schulze-Hentrich, J. M.; Riess, O.; Brunner, H. G.; Brookes, A. J.; Rath, A.; Bonne, G.; Gumus, G.; Verloes, A.; Hoogerbrugge, N.; Evangelista, T.; Harmuth, T.; Swertz, M.; Spalding, D.; Hoischen, A.; Beltran, S.; Graessner, H.; Haack, T. B.; Zurek, B.; Ellwanger, K.; Demidov, G.; Sturm, M.; Kessler, C.; Wayand, M.; Wilke, C.; Traschutz, A.; Schols, L.; Hengel, H.; Heutink, P.; Brunner, H.; Scheffer, H.; Steyaert, W.; Sablauskas, K.; de Voer, R. M.; Kamsteeg, E. -J.; van de Warrenburg, B.; van Os, N.; te Paske, I.; Janssen, E.; de Boer, E.; Steehouwer, M.; Yaldiz, B.; Kleefstra, T.; Veal, C.; Gibson, S.; Wadsley, M.; Mehtarizadeh, M.; Riaz, U.; Warren, G.; Dizjikan, F. Y.; Shorter, T.; Straub, V.; Bettolo, C. M.; Specht, S.; Clayton-Smith, J.; Banka, S.; Alexander, E.; Jackson, A.; Faivre, L.; Thauvin, C.; Vitobello, A.; Denomme-Pichon, A. -S.; Duffourd, Y.; Tisserant, E.; Bruel, A. -L.; Peyron, C.; Pelissier, A.; Beltran, S.; Gut, I. G.; Laurie, S.; Piscia, D.; Matalonga, L.; Papakonstantinou, A.; Bullich, G.; Corvo, A.; Garcia, C.; Fernandez-Callejo, M.; Hernandez, C.; Pico, D.; Paramonov, I.; Lochmuller, H.; Gumus, G.; Bros-Facer, V.; Hanauer, M.; Olry, A.; Lagorce, D.; Havrylenko, S.; Izem, K.; Rigour, F.; Stevanin, G.; Durr, A.; Davoine, C. -S.; Guillot-Noel, L.; Heinzmann, A.; Coarelli, G.; Allamand, V.; Nelson, I.; Yaou, R. B.; Metay, C.; Eymard, B.; Cohen, E.; Atalaia, A.; Stojkovic, T.; Macek, M.; Turnovec, M.; Thomasova, D.; Kremlikova, R. P.; Frankova, V.; Havlovicova, M.; Kremlik, V.; Parkinson, H.; Keane, T.; Senf, A.; Robinson, P.; Danis, D.; Robert, G.; Costa, A.; Patch, C.; Hanna, M.; Houlden, H.; Reilly, M.; Vandrovcova, J.; Muntoni, F.; Zaharieva, I.; Sarkozy, A.; Timmerman, V.; Baets, J.; Van de Vondel, L.; Beijer, D.; de Jonghe, P.; Nigro, V.; Banfi, S.; Torella, A.; Musacchia, F.; Piluso, G.; Ferlini, A.; Selvatici, R.; Rossi, R.; Neri, M.; Aretz, S.; Spier, I.; Sommer, A. K.; Peters, S.; Oliveira, C.; Pelaez, J. G.; Matos, A. R.; Jose, C. S.; Ferreira, M.; Gullo, I.; Fernandes, S.; Garrido, L.; Ferreira, P.; Carneiro, F.; Swertz, M. A.; Johansson, L.; van der Velde, J. K.; van der Vries, G.; Neerincx, P. B.; Roelofs-Prins, D.; Kohler, S.; Metcalfe, A.; Verloes, A.; Drunat, S.; Rooryck, C.; Trimouille, A.; Castello, R.; Morleo, M.; Pinelli, M.; Varavallo, A.; De la Paz, M. P.; Sanchez, E. B.; Martin, E. L.; Delgado, B. M.; de la Rosa, F. J. A. G.; Ciolfi, A.; Dallapiccola, B.; Pizzi, S.; Radio, F. C.; Tartaglia, M.; Renieri, A.; Benetti, E.; Balicza, P.; Molnar, M. J.; Maver, A.; Peterlin, B.; Munchau, A.; Lohmann, K.; Herzog, R.; Pauly, M.; Macaya, A.; Marce-Grau, A.; Osorio, A. N.; de Benito, D. N.; Lochmuller, H.; Thompson, R.; Polavarapu, K.; Beeson, D.; Cossins, J.; Cruz, P. M. R.; Hackman, P.; Johari, M.; Savarese, M.; Udd, B.; Horvath, R.; Capella, G.; Valle, L.; Holinski-Feder, E.; Laner, A.; Steinke-Lange, V.; Schrock, E.; Rump, A.. - In: EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. - ISSN 1018-4813. - 29:9(2021), pp. 1325-1331. [10.1038/s41431-021-00859-0]
Solve-RD: systematic pan-European data sharing and collaborative analysis to solve rare diseases
Zurek B.;Ellwanger K.;Vissers L. E. L. M.;Schule R.;Synofzik M.;Topf A.;de Voer R. M.;Laurie S.;Matalonga L.;Gilissen C.;Ossowski S.;'t Hoen P. A. C.;Vitobello A.;Schulze-Hentrich J. M.;Riess O.;Brunner H. G.;Brookes A. J.;Rath A.;Bonne G.;Gumus G.;Verloes A.;Hoogerbrugge N.;Evangelista T.;Harmuth T.;Swertz M.;Spalding D.;Hoischen A.;Beltran S.;Graessner H.;Haack T. B.;Zurek B.;Ellwanger K.;Demidov G.;Sturm M.;Kessler C.;Wayand M.;Wilke C.;Traschutz A.;Schols L.;Hengel H.;Heutink P.;Brunner H.;Scheffer H.;Steyaert W.;Sablauskas K.;de Voer R. M.;Kamsteeg E. -J.;van de Warrenburg B.;van Os N.;te Paske I.;Janssen E.;de Boer E.;Steehouwer M.;Yaldiz B.;Kleefstra T.;Veal C.;Gibson S.;Wadsley M.;Mehtarizadeh M.;Riaz U.;Warren G.;Dizjikan F. Y.;Shorter T.;Straub V.;Bettolo C. M.;Specht S.;Clayton-Smith J.;Banka S.;Alexander E.;Jackson A.;Faivre L.;Thauvin C.;Vitobello A.;Denomme-Pichon A. -S.;Duffourd Y.;Tisserant E.;Bruel A. -L.;Peyron C.;Pelissier A.;Beltran S.;Gut I. G.;Laurie S.;Piscia D.;Matalonga L.;Papakonstantinou A.;Bullich G.;Corvo A.;Garcia C.;Fernandez-Callejo M.;Hernandez C.;Pico D.;Paramonov I.;Lochmuller H.;Gumus G.;Bros-Facer V.;Hanauer M.;Olry A.;Lagorce D.;Havrylenko S.;Izem K.;Rigour F.;Stevanin G.;Durr A.;Davoine C. -S.;Guillot-Noel L.;Heinzmann A.;Coarelli G.;Allamand V.;Nelson I.;Yaou R. B.;Metay C.;Eymard B.;Cohen E.;Atalaia A.;Stojkovic T.;Macek M.;Turnovec M.;Thomasova D.;Kremlikova R. P.;Frankova V.;Havlovicova M.;Kremlik V.;Parkinson H.;Keane T.;Senf A.;Robinson P.;Danis D.;Robert G.;Costa A.;Patch C.;Hanna M.;Houlden H.;Reilly M.;Vandrovcova J.;Muntoni F.;Zaharieva I.;Sarkozy A.;Timmerman V.;Baets J.;Van de Vondel L.;Beijer D.;de Jonghe P.;Nigro V.;Banfi S.;Torella A.;Musacchia F.;Piluso G.;Ferlini A.;Selvatici R.;Rossi R.;Neri M.;Aretz S.;Spier I.;Sommer A. K.;Peters S.;Oliveira C.;Pelaez J. G.;Matos A. R.;Jose C. S.;Ferreira M.;Gullo I.;Fernandes S.;Garrido L.;Ferreira P.;Carneiro F.;Swertz M. A.;Johansson L.;van der Velde J. K.;van der Vries G.;Neerincx P. B.;Roelofs-Prins D.;Kohler S.;Metcalfe A.;Verloes A.;Drunat S.;Rooryck C.;Trimouille A.;Castello R.;Morleo M.;Pinelli M.;Varavallo A.;De la Paz M. P.;Sanchez E. B.;Martin E. L.;Delgado B. M.;de la Rosa F. J. A. G.;Ciolfi A.;Dallapiccola B.;Pizzi S.;Radio F. C.;Tartaglia M.;Renieri A.;Benetti E.;Balicza P.;Molnar M. J.;Maver A.;Peterlin B.;Munchau A.;Lohmann K.;Herzog R.;Pauly M.;Macaya A.;Marce-Grau A.;Osorio A. N.;de Benito D. N.;Lochmuller H.;Thompson R.;Polavarapu K.;Beeson D.;Cossins J.;Cruz P. M. R.;Hackman P.;Johari M.;Savarese M.;Udd B.;Horvath R.;Capella G.;Valle L.;Holinski-Feder E.;Laner A.;Steinke-Lange V.;Schrock E.;Rump A.
2021
Abstract
For the first time in Europe hundreds of rare disease (RD) experts team up to actively share and jointly analyse existing patient’s data. Solve-RD is a Horizon 2020-supported EU flagship project bringing together >300 clinicians, scientists, and patient representatives of 51 sites from 15 countries. Solve-RD is built upon a core group of four European Reference Networks (ERNs; ERN-ITHACA, ERN-RND, ERN-Euro NMD, ERN-GENTURIS) which annually see more than 270,000 RD patients with respective pathologies. The main ambition is to solve unsolved rare diseases for which a molecular cause is not yet known. This is achieved through an innovative clinical research environment that introduces novel ways to organise expertise and data. Two major approaches are being pursued (i) massive data re-analysis of >19,000 unsolved rare disease patients and (ii) novel combined -omics approaches. The minimum requirement to be eligible for the analysis activities is an inconclusive exome that can be shared with controlled access. The first preliminary data re-analysis has already diagnosed 255 cases form 8393 exomes/genome datasets. This unprecedented degree of collaboration focused on sharing of data and expertise shall identify many new disease genes and enable diagnosis of many so far undiagnosed patients from all over Europe.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.